Все же мне кажется, что -ис изначально. Все это небольшие населенные пункты, которые могли начинаться с одного хозяина, например, эйшис, жодис, василис, германис, юратис, михалис, а дальше, как пошли дети и семья росла славяне добавляли -ки (так как, например, речки, будки, репки, бабки

)), получалось - эйшиски, василиски, германиски, михалиски, жодиски, юратиски. Только славянам, мне думается, особенно дзэкающим будет проще говорить эйшиШки, василиШки, германиШки, михалиШки, жодиШки, юратиШки. И это все должно быть и есть там, где смесь самая балтского и славянского. Имхо.